767.锁定

免疫检查点阻断、个性化肿瘤疫苗和溶瘤病毒疗法等免疫疗法的出现是抗肿瘤治疗史上的一个里程碑。不幸的是，免疫治疗只对有限的癌症类型有效，患者很可能在短时间内产生耐药性。最近的研究表明，在大多数实体癌中，高的肿瘤突变负荷不能作为预测应答的精确生物标志物。因此，需要免疫治疗结果的预测性生物标志物。然而，对于免疫治疗如何改变免疫微环境，以及它如何通过肿瘤非肿瘤细胞相互作用发挥作用，我们知之甚少。肿瘤浸润性淋巴细胞是肿瘤微环境的重要组成部分，影响预后和临床特征，在肿瘤免疫治疗中发挥基础性作用。因此，对s进行全面、动态的监测有助于进一步探索肿瘤免疫治疗的边界。
测序技术为细胞生物学、疾病病原学和药物反应提供了新的见解。批量测序研究以整个肿瘤为靶点，分析肿瘤内细胞的平均基因表达。然而，反映潜在异质性和可塑性的特定功能亚群可能被忽视。肿瘤主要由肿瘤细胞、间质细胞和免疫细胞组成，这些细胞可分为不同的亚型。这些细胞构成了肿瘤异质性，在肿瘤进展中起主要作用。sseq的存在可以通过分析和量化单个细胞的整个转录组来探索肿瘤异质性。对于单个细胞，其遗传学和表观遗传学被揭示来预测其在癌症中的作用和对治疗的反应。此外，基于单个细胞的空间转录揭示了单个细胞在原始肿瘤中的空间位置和细胞间通讯的局部网络。
最近，许多癌症类型的免疫环境，如黑色素瘤，乳腺癌，肝癌，非小细胞肺癌，已经被sseq揭示，其中细胞，细胞，骨髓源性抑制细胞，树突状细胞，它们分泌的细胞因子趋化因子构成了一个复杂的相互作用网络。令人印象深刻的是，细胞一直是研究抗肿瘤功能的主要焦点，包括nve细胞、效应记忆细胞、衰竭细胞、调节性细胞和居住记忆细胞，这些在几种癌症中都有描述。细胞作为体液免疫的主要效应体，在成分和免疫治疗反应中也有显著作用。大量测序显示，细胞相关标记物在免疫治疗应答者和非应答者之间表达差异最大。细胞以三种方式攻击癌症1分泌免疫球蛋白介导抗体依赖性细胞毒性、抗体依赖性细胞吞噬作用和补体依赖性细胞毒性;2抗原提呈激活细胞;3分泌rnzye、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体和直接杀伤肿瘤细胞。因此，肿瘤浸润细胞可能对肿瘤预后有重要意义，并可作为预测免疫治疗的生物标志物。然而，专注于细胞的研究比专注于细胞的研究要少得多，这使得它们在癌症免疫治疗中的复杂机制不清楚。随着sseq技术的发展，s的位置和功能可以被精确地确定，这可能有助于更好地理解其机制。从单细胞的角度来看，在本文中，我们讨论s亚种群分化轨迹，与其他细胞的相互作用，并总结细胞的机制调节时间和影响免疫治疗效果，旨在为肿瘤研究提供一种新的方式针对细胞。
单细胞测序可以进一步探索肿瘤内的异质性。与流式细胞术、质谱法或其他任何以前的方法不同，单细胞测序是一种连续的方法，而不是离散的方法。sseq的步骤主要包括以下四个步骤单细胞分离，反转录成，扩增，测序库构建。荧光激活细胞分选可用于从组织中分离特定的细胞。在细胞研究方面，采用流式细胞术筛选45细胞，增加细胞的比例也可根据细胞标记物直接选择靶向细胞。作为sseq技术的突破，微流控系统将单个细胞封装在独立的微液滴中，该微液滴包含一个独特的分子标识符，用于对单细胞内的微转录材料进行条形码。根据每个细胞的，即使细胞被裂解，在后续的分析中也可以找到转录信息。基于这一特点，10enishriu平台同时测序数千个细胞。与rtseq2等低通量方法相比，10enishriu平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于细胞检测。
在对多种sseq方法的比较研究中，10enis也比其他高通量方法如rpseq和ndrps具有更高的灵敏度，更高的与线粒体基因匹配的reds比例，更低的噪声。利用10enis和rtseq2平台，可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分中细胞的亚群，聚类结果无明显差异。但是，10enis也有不足之处，它不能覆盖所有的基因，并且存在3区域偏倚，在检测基因突变或剪接位点时可能会遗漏一些重要信息。此外，这种方法对细胞质量有更高的要求，不同的组织和不同的获取样本的方法都不同。利用sseq，我们可以更精确地定义细胞的亚型，追踪它们的发育谱系，确定克隆型和表现型之间的关系，绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图，从而从多个维度描述。此外，还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果。我们总结了使用sseq研究的最新出版物
细胞受体是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白，在细胞的分化成熟过程中起着重要作用。由两条重链和两条轻链组成，其中可变、多样性和连接基因序列的重组创造了细胞的多样性。这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难。然而，由于每个细胞通常表达一个单一的受体，潜在的抗原特异性受体可以通过给定的原细胞链发现。的两个主要功能如下。首先，它通过诱导细胞激活过程中肌动蛋白骨架的实质改变和各种基因的表达来激活细胞。其次，它介导抗原的鉴定和提取，从而导致加工过的肽在主要组织相容性复合体上呈现给辅助细胞。因此，测序有助于进一步了解细胞分化的轨迹及其特异性识别抗原性的机制，特别是当与单个细胞的完整转录组身份配对时，这为了解癌症的发展提供了线索。更重要的是，测序可以追踪来自单细胞的群体，揭示克隆型和表型之间的关系。seq技术在测序中具有天然优势，因为含有的微流控系统可以保证同源配对的保存，而这些同源配对在细胞批量测序中可能会丢失。是一个在单细胞分辨率上进行测序的平台。作为重建配对全长序列的工具，re为细胞的克隆推断和谱系追踪提供了一个完整的管道。seq是一种高通量的方法，将se序列与其同源抗原特异性连接起来，可以用来绘制特定对象中数千个细胞的抗原特异性。
研究免疫球蛋白以探讨体液免疫的复杂性
免疫球蛋白存在于肿瘤和血清中，在肿瘤中起双重作用。抗体通过其片段可结晶支配功能，并受翻译后修饰调控。通常，免疫球蛋白是由骨髓和脾脏的浆细胞分泌的。组织炎症区域和肿瘤内部的p，特别是在三级淋巴结构中，分泌肿瘤相关抗体并直接在肿瘤上诱导原位效应。在抗肿瘤功能方面，g是最重要的一类人免疫球蛋白，因为它能够结合巨噬细胞和自然杀伤细胞上的受体，并促进、和的作用。此外，g对抗原处理和呈递至关重要，因为抗原呈递细胞上的受体可以与g包被的免疫复合物结合，激活细胞。抗体和抗体分泌细胞的单细胞测序有助于进一步明确细胞体液免疫的复杂网络。已经报道了一种单细胞液滴微流控测序方案，用于特异性结合靶细胞的抗体，这也适用于初级人类li是一种液滴微流体系统，用于高通量单细胞筛选分泌g的原代细胞，一方面，通过基于荧光的液滴内单细胞生物测定检测g活性，另一方面，用brded反转录对配对的基因进行测序。
外周血未成熟细胞通过高内皮静脉进入淋巴滤泡。在细胞滤泡中，nve细胞通过固有p接触抗原，之后激活信号诱导抗原提取、内化和加工，将肽呈现在上。然后，细胞迁移到与细胞相邻的滤泡区边缘，将抗原呈递给滤泡辅助细胞。因此，fh细胞刺激，诱导nve细胞分化，主要包括记忆细胞、短命细胞和生发中心细胞。这些不依赖的s表达13，可能增加抗性。此外，它们缺乏细胞进入和离开s的7和183。为了分化为细胞，它们首先进入的暗区，在那里它们的膜表面免疫球蛋白通过体细胞高突变发生变化，称为亲和成熟。接下来，它们在亮区经历一个竞争过程，在那里许多细胞聚集，它们的命运取决于它们与fh细胞的相互作用，可能有能力捕获和呈现抗原，并发生类转换重组。这个过程也依赖于fh细胞分化的结果，导致细胞的结果。低亲和性细胞成为长寿命s，高亲和性细胞成为s，其他细胞凋亡或重新进入进行和克隆扩增。最近的研究表明，y细胞亚群包括亲和力较高的前体或未来的进入者，以及一些亲和力较低的前体。值得注意的是，在这个过程中起主要作用，细胞分化的体液免疫过程中两个重要的检查点是nve细胞和细胞上的抗原提呈，这可能会提高体液免疫应答。此外，在单细胞水平上的完整转录组字符化将特别有助于确定nve细胞向分化过程中的转录轨迹和异质性。
细胞分布不均一
以往对细胞的研究主要基于免疫组化或流式细胞术，限制了细胞的清晰分类。uters等人回顾了69项研究，研究tilb在19种癌症中的预后意义，以探索细胞对抗肿瘤免疫贡献的不确定性，其中系细胞的预后意义不同。有研究发现细胞激活髓样细胞上的受体，促进鳞状细胞的癌变。然而，带有抗d20抗体的细胞耗竭促进小鼠中黑色素瘤的发生。到目前为止，细胞在肿瘤中的功能尚不清楚。这主要是由于在不同的组织中存在不同的细胞亚群，在分类、功能和空间上。sseq的应用提供了高分辨率，可以揭示不同组织间分布的不确定性和不均匀性，从而揭示免疫原性或免疫抑制性。通常，细胞只占正常人体器官细胞组成的一小部分。例如，细胞在正常胰腺组织中是有限的，但在胰腺癌中约占5。在原发肺肿瘤中，细胞也比正常肺组织增加。此外，正常肺组织中浸润的多为分泌rnzye的细胞毒细胞，而在原发性肺肿瘤和淋巴结转移中，由于肿瘤抗原的克隆扩增和生成，不同br的细胞增多。同样，与正常乳腺组织相比，原发性乳腺癌中s密度增加。此外，在乳腺癌中，s比细胞在次级淋巴组织中表达更多的h1效应细胞因子，提示1型细胞免疫应答。在一个三阴性乳腺癌队列中，sseq证据显示，中的细胞具有更多的和的s特征，而s则富含更多的nve细胞。这可能是因为原发性肿瘤发生时，外周血中大量nve细胞受到高质量肿瘤新抗原的刺激，在s中发生，从而迁移到或。然而，通过sseq分析，与癌旁组织和癌前组织相比，人类组织的增殖状态更高，分散程度更高，类基因评分更低，抗原呈递能力更低，提示存在不同的免疫抑制。